Мероприятие проводилось при поддержке Российского фонда фундаментальных исследований, Проект № 16-04-20923

Материалы

Научного семинара

www.genetics-events.org

Мероприятие проводилось при поддержке Российского фонда фундаментальных исследований, Проект № 16-04-20923

Москва, 2016

СПОНСОРЫ СЕМИНАРА

Главный партнер семинара:

Компания БиоВитрум

http://www.biovitrum.ru/

- оплата приезда и проживания руководителя Геномной платформы Девида Жетьена из Института Кюри (Париж, Франция)

-оплата кофе-брейков

-предоставление реактивов для практической школы:

НАБОР ДЛЯ ВЫДЕЛЕНИЯ РНК компании Norgen

Cотрудники компании, принимавшие участие в семинаре и практической школе:

Элина ЧиганРуководитель группы Life Science [e-mail]

Алена АлексееваСпециалист по молекулярной биологии [e-mail]

Юлия КутузоваСпециалист по молекулярной биологии

 

3D БИОЛОГИЯ: Анализ экспрессии, копийности генов, белка и детекция мутаций, хромосомных перестроек. Контакты: [e-mail] 8-926-186-58-50 Миля

 

Компания Thermo Fisher Scientific

www.thermofisher.com

- предоставление блокнотов, ручек, флешек для семинара

- предоставление реактивов для практической школы:

K156001 PURELINK TOTAL RNA BLOOD KIT 50 REACTIONS

18090050 SUPERSCRIPT IV 10,000 units

10328011 RNASE AWAY 250ML

4444556 TAQMAN FAST ADVANCED MMIX 1 ML

4448892 TAQMAN GENE EX ASSAYS MTO, XS

4453320 TAQMAN GENE EX ASSAYS INV, XS

4331182 FG, OFF THE SHELF GX SET

Cотрудники компании, принимавшие участие в семинаре и практической школе:

	Елена Анатольевна Чеховских Менеджер по развитию бизнеса [e-mail]
	Алексей Сергеевич Пазилин Менеджер по развитию бизнеса кПЦР [e-mail]
	Владимир Олегович Соколов Специалист научной поддержки

Компания Хеликон

www.helicon.ru

- оплата травел гранта для аспирантки Климентовой Е.А. из Института Биохимии и Генетики Уфимского Научного Центра РАН

- предоставление оборудования для практической школы:

QuantStudio 5 –АМПЛИФИКАТОР С ДЕТЕКЦИЕЙ В РЕЖИМЕ РЕАЛЬНОГО ВРЕМЕНИ

-предоставление реактивов для практической школы:

НАБОРЫ ДЛЯ ИССЛЕДОВАНИЯ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ, НА ОСНОВЕ ТЕХНОЛОГИИ TaqMan

-предоставление пластика для практической школы:

HT-F96S-100 (82240) -Наконечники Unitips до 100 мкл с фильтром 96 шт.

в штативе (cтерильные),

HT-F96S-200 (83240)- Наконечники Unitips до 200 мкл с фильтром 96 шт/уп в штативе (стерильные)

SSI-4237N AFS -Посуда из полимерных материалов для лабораторных исследований in vitro: наконечники универсальные с фильтром для лабораторных дозаторов объемом до 20 мкл, стерильные, упакованные в штативы, 96 шт/штатив

SSI-4337NSFS - Посуда из полимерных материалов для лабораторных исследований in vitro: наконечники универсальные с фильтром для лабораторных дозаторов объемом до 1000 мкл, стерильные, упакованные в штативы, 96 шт/штатив

SSI-4237NS0S -Посуда из полимерных материалов для лабораторных исследований in vitro: наконечники универсальные для лабораторных дозаторов, объемом до 200 мкл, стерильные, упакованные в штативы, 96 шт/штатив

SSI-4337NS0S -Посуда из полимерных материалов для лабораторных исследований in vitro: наконечники универсальные для лабораторных дозаторов, объемом до 1000 мкл, стерильные, упакованные в штативы, 96 шт./штатив

SSI-1260-00 -Посуда из полимерных материалов для лабораторных исследований in vitro: пробирки микроцентрифужные объемом 1,5 мл с крышками, нестерильные, градуированные, упакованные в пакеты, 500 шт/уп

Cотрудники компании, принимавшие участие в семинаре и практической школе:

Ольга Чумаколенко Менеджер по рекламе [e-mail]

Филиппенко Екатерина

 

ООО "ДНК-Технология"

www.dna-technology.ru

- предоставление блокнотов, ручек для семинара

- предоставление оборудования для практической школы:

АМПЛИФИКАТОРЫ DT-96 С ДЕТЕКЦИЕЙ В РЕЖИМЕ РЕАЛЬНОГО ВРЕМЕНИ

 

Ксения Николаева Специалист технологической поддержки зарубежных клиентов [e-mail]

 

ЕВРОГЕН

www.evrogen.com

 

-предоставление реактивов для практической школы:

SK021 Hабор реактивов MMLV RT kit

PK147S qPCRmix –HS SYBR

Марина Хрущева

[e-mail]

 

ОРГАНИЗАЦИОННЫЙ КОМИТЕТ

	РОМАН АЛЕКСЕЕВИЧ ЗИНОВКИН МГУ им. М.В. Ломоносова НИИ ФХБ имени А.Н. Белозерского МГУ Руководитель проекта № 16-04-20923 (Грант РФФИ)
	ЮЛИЙ ВАЛЕРЬЕВИЧ ШИДЛОВСКИЙ Заведующий лабораторией регуляции экспрессии генов в развитии, Институт Биологии Гена РАН, [e-mail]
	МАДИНА ХУСЕЙНОВНА БОГАТЫРЕВА Заместитель декана по учебной работе факультета биоинженерии и биоинформатики МГУ имени М.В. Ломоносова [e-mail]
	НАТАЛЬЯ НИКОЛАЕВНА СИДОРОВА НИИ ФХБ имени А.Н. Белозерского МГУ Секретарь семинара
	МИХАИЛ ЮРЬЕВИЧ ВЫСОКИХ Заведующий лабораторией молекулярных механизмов старения НИИ ФХБ имени А.Н. Белозерского МГУ [e-mail]
	МИХАИЛ ВАСИЛЬЕВИЧ МИХАЙЛОВ   Ассоциация Молекулярных Генетиков Программист и техническая поддержка сайта cеминара www.genetics-events.org
	МИЛЯУША КАВЫЕВНА ТАГИРОВА Учредитель и руководитель Ассоциации Молекулярных Генетиков, НИИ ФХБ имени А.Н. Белозерского МГУ [e-mail] Секретарь семинара
	МАРИЯ МИХАЙЛОВНА БЯХОВА Учредитель и председатель Ассоциации Молекулярных Генетиков
	КОНСТАНТИН ГЕННАДЬЕВИЧ ЛЯМЗАЕВ НИИ ФХБ имени А.Н. Белозерского МГУ
	ПОЛИНА АЛЕКСАНДРОВА ВИШНЯКОВА Ассоциация Молекулярных Генетиков
	СВЕТЛАНА РОГУЛИНА Ассоциация Молекулярных Генетиков художник логотипа семинара [e-mail]

ПРЕДСЕДАТЕЛЬ ПРОГРАММНОГО КОМИТЕТА:

БОРИС ФЕДОРОВИЧ ВАНЮШИН Член-корр. РАН, профессор, д.б.н. Заведующий лабораторией молекулярных механизмов старения НИИ ФХБ имени А.Н. Белозерского МГУ

ПРОГРАММНЫЙ КОМИТЕТ:

1. Шидловский Юлий Валерьевич (д.б.н., профессор РАН), Заведующий лабораторией регуляции экспрессии генов в развитии, Институт Биологии Гена РАН

2. Зиновкин Роман Алексеевич (к.б.н.), Научный сотрудник кафедры вирусологии Биологического факультета МГУ им. М.В. Ломоносова

3. Высоких Михаил Юрьевич (к.б.н.), Заведующий лабораторией молекулярных механизмов старения НИИ ФХБ им. А.Н. Белозерского МГУ

4. Тагирова Миляуша Кавыевна, Руководитель Ассоциации Молекулярных Генетиков

Декабря 2016 г

10:00 – 12:30	Открытие международного научного семинара Приветствие участников семинара – 10:00 – 11:30 Девид Жетьен Организационные вопросы – 11:30 – 11:45 11:45 – 12:30 Муромская А. «Технология Nanostring для анализа экспрессии генов». Компания ООО «БиоВитрум»
12:30 – 14:00	Обед
14:00 – 15:35	Сессия «Регуляторные элементы генома» Председатели: Тагирова М.К. (Россия), д.б.н. Шидловский Ю.В. (Россия) 14:00 – 14:15 Шидловский Ю.В. «Энхансеры, промоторы и инсуляторы в пространстве клеточного ядра». Институт Биологии Гена, Москва, Россия 14:20 – 14:35 Зиновкин Р.А. «Экспрессия и регуляция митохондриальных генов» НИИ ФХБ им. А.Н. Белозерского, Москва, Россия 14:40 – 14:55 Попова А.А., Кокшарова О.А. «Регуляторный эффект небелковой аминокислоты БМАА на экспрессию генов цианобактерии Nostoc sp. PCC 7120» Институт Молекулярной Генетики РАН, Москва, Россия 15:00 – 15:15 Cергеева В.А., Костюк С.В. «Влияние трех водорастворимых производных фуллерена С60 на различные клетки человека» Медико-Генетический Научный центр, Москва, Россия 15:20 – 15:35 Сивопляс Е.А., Кутузова Н.М., Куликов А.М. «Регуляция экспрессии высококонсервативного гена DRAS1 с помощью микроРНК у дрозофил группы Virilis» ФГБОУ ВО «Московский педагогический государственный университет» (МПГУ), Москва, Россия
15:35 – 16:00	Кофе-брейк, постерная сессия
16:00 – 17:00	Сессия «Факторы транскрипции и хроматин» Председатели: д.б.н. Шидловский Ю.В. (Россия), к.б.н. Высоких М.Ю. (Россия) 16:00 – 16:15 Барлев Н.А. "Координация ковалентных модификаций гистонов и транскрипционных факторов как механизм регуляции экспрессии генов" ФГБУН «Институт цитологии РАН», Санкт-Петербург, Россия 16:20 – 16:35 Филиппенков И.Б., Дергунова, Л.В., Лимборская С. A. "Изучение некодирующих РНК гена сфингомиелинсинтазы 1 (SGMS1) человека" Институт молекулярной генетики РАН, Москва, Россия 16:40 – 17:00 Атякшин Д.А., Бурцева А.С., Цветикова Л.Н. "Соотношение экспрессии протеаз в тучных клетках желудка монгольских песчанок после орбитального полета" ФГБО ВО Воронежский государственный медицинский университет имени Н.Н. Бурденко Минздрава РФ, НИИ Экспериментальной биологии и медицины
8 декабря 2016 г.
9:00 – 11:00	Сессия «Экспрессия генов в норме и при патологии» Председатели: к.б.н. Зиновкин Р.А.(Россия) 9:00 – 9:15 Климентова Е.А., Гилязова И.Р., Кунсбаева Г.Б., Султанов И.М., Измайлов А.А., Павлов В.Н., Хуснутдинова Э.К. "Исследование профилей экспрессии генов микроРНК у пациентов со светлоклеточным раком почки" Уфимский научный центр Российской Академии Наук 9:20 – 9:35 Никитин А., Гордеев М. "Анализ специфичных факторов транскрипции с помощью GAGE на примере аденокарциномы легкого" Федеральный Научно-Клинический Центр ФМБА, Москва, Россия 9:40 – 11:00 – Кофе-брейк, постерная сессия Круглый стол «Обсуждение вопросов по анализу экспрессии генов»
11:00 – 12:35	Сессия «Экспрессия генов в норме и при патологии» (продолжение) Председатели: Тагирова М.К. (Россия), к.б.н. Жетьен Д.(Франция) 11:00 – 11:15 Бяхова М.М. «Амплификация гена Her2 при раке молочной железы» МОНИКИ им. М.Ф. Владимирского, Москва, Россия 11:20 – 11:35 Жетьен Девид «Опыт использования тест системы Prosigna для диагностики рака молочной железы во Франции» Институт Мари Кюри, Париж, Франция 11:40 – 11:55 Бабенко А.С., Смирнов С.Ю. Ступак Д.С., Статкевич Л.В., Смолякова Р.М. "Экспрессия генов ACTB, GAPDH, HPRT1, SCARNA5, RNU12, RN7SL1 и RNA5-8S5 в опухолевой и морфологически неизмененной ткани" Республиканский научно-практический центр онкологии и медицинской радиологии им. Н.Н. Александрова, Минск, Беларусь 12:00 – 12:15 Антипова Н.В., Яненко Б.В., Моисеева Е.В., Аронов Д.А., Шахпаронов М.И. «Уровень экспрессии PON 1, 2, 3 в перитонеальных макрофагах мышей линии CBRB и А/Sn c перевиваемым раком молочной железы» ФГБУ ИБХ РАН, МГАВМиБ- МВА имени К.И. Скрябина, Москва, Россия
12:40 – 14:00	Обед
14:00 – 15:50	Сессия «Современные методы анализа экспрессии генов» Председатели: к.б.н. Высоких М.Ю. (Россия), к.б.н. Зиновкин Р.А.(Россия) 14:00 – 14:15 Вишнякова П.А. «Детекция экспрессии генов слияния митохондрий у Heterocephalusglaber методом ПЦР в реальном времени» ФГБУ «Научный центр акушерства, гинекологии и перинатологии» имени академика В.И.Кулакова Министерства здравоохранения Российской Федерации, Москва, Россия 14:20 – 14:35 Девятияров Р.М. «Транскриптомика на основе метода СAGE в изучении ангидробиоза» Институт фундаментальной медицины и биологии КФУ, Казань, Россия 14:40 – 15:00 Миляуша Тагирова «Технология Nanostring для анализа экспрессии генов в медицине», Ассоциация Молекулярных Генетиков, Москва, Россия 15:05 – 15:25 Пазилин Алексей «Решения Thermo Fisher Scientific для анализа экспрессии генов», Компания АО "Термо Фишер Сайентифик" 15:40 - награждение в номинации "Лучший доклад", "Лучший постер"
9 декабря 2016 - практическая школа

ДОКЛАДЧИКИ

ДЭВИД ЖЕТЬЕН Руководитель Геномной платформы, Институт Мари Кюри, Париж, Франция     [e-mail]	ЮЛИЙ ШИДЛОВСКИЙ Заведующий лабораторией регуляции экспрессии генов в развитии, Институт Биологии Гена РАН, Москва, Россия   [e-mail]	МАРИЯ БЯХОВА МОНИКИ им. М.Ф. Владимирского Москва, Россия   [e-mail] \	ПОЛИНА ВИШНЯКОВА ФГБУ «Научный центр акушерства, гинекологии и перинатологии» имени академика В.И.Кулакова МЗ РФ Москва, Россия   [e-mail]
РОМАН ЗИНОВКИН МГУ им. М.В. Ломоносова Лаборатория молекулярной биологии Москва, Россия   [e-mail]	АЛЕКСАНДРА ПОПОВА ФГБУН Институт Молекулярной Генетики РАН, Москва, Россия     [e-mail]	АЛЕКСЕЙ НИКИТИН Лаборатория генетики Федеральный Научно-Клинический Центр ФМБА, Москва, Россия   [e-mail]	ИВАН ФИЛИППЕНКОВ Институт молекулярной генетики РАН, Москва, Россия     [e-mail]
ЕКАТЕРИНА СИВОПЛЯС ФГБОУ ВО «Московский педагогический государственный университет» (МПГУ) Москва, Россия   [e-mail]	ЕЛИЗАВЕТА КЛИМЕНТОВА Уфимский научный центр Российской Академии Наук, Уфа, Россия   [e-mail]	ДМИТРИЙ АТЯКШИН ФГБО ВО Воронежский государственный медицинский университет имени Н.Н. Бурденко Минздрава РФ, Воронеж, Россия   [e-mail]	ЕЛЕНА КОЧЕРЫЖКИНА Институт Биологии Гена РАН, Москва, Россия     [e-mail]
РУСЛАН ДЕВЯТИЯРОВ Институт фундаментальной медицины и биологии КФУ, Казань, Россия     [e-mail]	КСЕНИЯ НИКОЛАЕВА Специалист технологической поддержки зарубежных клиентов     [e-mail]	АЛЕКСЕЙ ПАЗИЛИН Менеджер по развитию бизнеса кПЦР     [e-mail]	АНДРЕЙ БАБЕНКО   Республиканский научно-практический центр онкологии и медицинской радиологии Имени Н.Н. Александрова, Минск, Беларусь   [e-mail]

УЧАСТНИКИ

	Мелащенко Ольга Борисовна Центр медицинских биотехнологий ФГАОУ ВО «Балтийский федеральный университет имени Иммануила Канта», Россия, Калининград Научный сотрудник [e-mail] 236016 г. Калининград, ул. Боткина, д. 3, каб. 302 [phone] Тема исследований: Влияние ингибитора c-Jun N-терминальных киназ (IQ-1S) на функциональную активность Т-лимфоцитов и клеток моноцит/макрофагального ряда человека
	Шмаров Вячеслав Анатольевич Центр медицинских биотехнологий ФГАОУ ВО «Балтийский федеральный университет имени Иммануила Канта», Россия, Калининград Аспирант, инженер-исследователь [e-mail] 236016 г. Калининград, ул. Боткина, д. 3, каб. 302 [phone] Тема исследований: Роль интерлейкина-7 в регуляции гомеостатических и адаптивных Т-клеточных реакций
	Васенина Ольга Студентка ФГБОУ ВО Первый МГМУ имени И.М. Сеченова МЗ РФ, Москва
	Ильина Лариса Александровна к.б.н., начальник молекулярно-генетической лаборатории ООО "БИОТРОФ"

ПОСТЕРНАЯ СЕССИЯ

ЕЛЕНА КОЧЕРЫЖКИНА	ЯДЕРНЫЕ РЕЦЕПТОРЫ ECR, USP, E75, DHR3, ERR РЕГУЛИРУЮТ ТРАНСКРИПЦИЮ ГЕНОВ ЭКДИЗОНОВОГО КАСКАДА КОЧЕРЫЖКИНА Е.В^.1, МАЗИНА М.Ю^1, ВОРОБЬЕВА Н.Е.^1 ^1ОТДЕЛ РЕГУЛЯЦИИ ТРАНСКРИПЦИИ И ДИНАМИКИ ХРОМАТИНА, ИНСТИТУТ БИОЛОГИИ ГЕНА РАН, МОСКВА
АННА ПРАВЕДНИКОВА	РОЛЬ ОДНОНУКЛЕОТИДНЫХ ПОЛИМОРФИЗМОВ ГЕНА UCP1 В РАЗВИТИИ КАРДИОМЕТАБОЛИЧЕСКИХ ЗАБОЛЕВАНИЙ ПРАВЕДНИКОВА А. Э. ^1,2, ШЕВЧЕНКО С.Ю.^1, ВАСЕНИНА О.^1,2, ЛАРИНА С.Н.^2, СЕРЖАНОВА В.^1, КЕРЧЕВ В.^1,2, ШИДЛОВСКИЙ Ю.В.^1 ФГБУН ИНСТИТУТ БИОЛОГИИ ГЕНА РАН, МОСКВА ФГБОУ ВО ПЕРВЫЙ МГМУ ИМ. И.М. СЕЧЕНОВА МИНЗДРАВА РОССИИ, МОСКВА
МАРИЯ ВАЛИЕВА	STABILIZATION OF TAILLESS NUCLEOSOME BY HUMAN FACT VALIEVA M.E.^1, GERASIMOVA N.S.^1, KUDRYASHOVA K.S. ^1,2, KOZLOVA A.^1, HU Q^3, BOTUYAN M.V.^3, MER G.^3, FEOFANOV A.V.^1,2, STUDITSKY V.M^.1,4 ^1 BIOLOGY FACULTY, LOMONOSOV, MOSCOW STATE UNIVERSITY, LENINSKIE GORY 1, MOSCOW, 119992, RUSSIA ^2SHEMYAKIN-OVCHINNIKOV INSTITUTE OF BIOORGANIC CHEMISTRY OF RUSSIAN ACADEMY OF SCIENCES, MOSCOW, 117997, RUSSIA ^3 DEPARTMENT OF BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY, MAYO CLINIC, ROCHESTER, MN 55905, USA ^4FOX CHASE CANCER CENTER, PHILADELPHIA, PA 19111, USA
АНАСТАСИЯ КОЗЛОВА	ИЗУЧЕНИЕ ОБРАЗОВАНИЯ МУЛЬТИМОЛЕКУЛЯРНЫХ КОМПЛЕКСОВ ДРОЖЖЕВОГО БЕЛКА NHP6 СО СВОБОДНОЙ И НУКЛЕОСОМНОЙ ДНК КОЗЛОВА А.Л., ГЕРАСИМОВА Н.С., ВАЛИЕВА М.Е., СТУДИТСКИЙ В.М. МГУ ИМ.М.В.ЛОМОНОСОВА, МОСКВА

ПРАКТИЧЕСКАЯ ШКОЛА

Практическая школа проводилась на базе Лаборатории молекулярных механизмов старения НИИ ФХБ имени А.Н. Белозерского по адресу: 119992, Москва, Ленинские горы, дом 1, стр. 40, комната 238 и 239.

Сотрудники лаборатории:

Заведующий лабораторией к.б.н. Михаил Юрьевич Высоких [e-mail]

Сотрудница Полина Вишнякова [e-mail]

Сотрудница Миляуша Тагирова [e-mail]

 

В данной лаборатории содержатся колонии долгоживущих грызунов Heterocephalus glaber.

Колония Голых землекопов (Heterocephalus glaber)

ОЛЬГА АВЕРИНА Младший научный сотрудник лаборатории Область интересов: геронтология, биология развития и старения

 

 

В практической школе было показано выделение РНК, постановка обратной транскрипции и ПЦР в режиме реального времени для детекции экспрессии генов.

Инструкторы школы:

	ПОЛИНА ВИШНЯКОВА Лаборатория молекулярных механизмов старения НИИ ФХБ имени А.Н. Белозерского МГУ Москва, Россия	Постановка обратной транскрипции и анализ экспрессии генов с помощью ПЦР в режиме реального времени
	ИВАН ФИЛИППЕНКОВ Институт молекулярной генетики РАН, Москва, Россия	Постановка электрофореза для детекции качества РНК
	МИЛЯУША ТАГИРОВА Лаборатория молекулярных механизмов старения НИИ ФХБ имени А.Н. Белозерского МГУ Москва, Россия	Выделение РНК
	РОМАН ЗИНОВКИН НИИ ФХБ имени А.Н. Белозерского МГУ	Оценка количества выделенной РНК
	ВЛАДИМИР СОКОЛОВ Специалист научной поддержки Thermo Fisher Scientific	Выделение РНК, постановка обратной транскрипции и анализ экспрессии генов с помощью ПЦР в режиме реального времени

ТЕЗИСЫ

ЧЕЛОВЕКА В ОНТОГЕНЕЗЕ

ГОЛУБЦОВА Н.Н.*, ФИЛИППОВ Ф.Н., ГУНИН А.Г.

ФГБОУ ВПО «ЧУВАШСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМЕНИ И.Н.УЛЬЯНОВОЙ»

*[e-mail]

Цель: определение уровня экспрессии ламинов А, В1, В2 и ламин ассоциированного полипептида-2-альфа (LAP-2α) в фибробластах и процента положительно окрашенных фибробластов в дерме человека в возрастном аспекте.

Методы: исследования проводились с применением непрямого иммуногистохимического метода. Было использовано 112 образцов кожи, которые разделили на 5 возрастных групп: 1 группа – 20-40 недель беременности, 2 группа – 0-20 лет, 3 группа – 21-40 лет, 4 группа – 41-60 лет, 5 группа – 61-85 лет. По каждой группе данных рассчитывали средние арифметические величины (М) и их стандартные ошибки (m). Достоверность влияния возраста и пола на исследуемые параметры кожи оценивали с помощью однофакторного дисперсионного анализа. Взаимосвязи между возрастом и параметрами кожи оценивали с применением непараметрического рангового корреляционного анализа Спирмена. Корреляционный анализ проводили без разделения данных на возрастные группы. Достоверными считали отличия при р<0,05.

Результаты: Было установлено, что процент фибробластов, содержащих ламин А и В2, планомерно уменьшался с возрастом, при этом уровень экспрессии ламина А и В2 в ядрах фибробластов практически не изменялся. В период от 20 до 40 недель беременности было выявлено 62,3% фибробластов с положительной окраской на ламин В1. Их содержание и уровень экспрессии ламина В1 уменьшались от 0-40 лет, а затем снова увеличивались в период от 41 года до 85 лет. Процент фибробластов с положительной окраской на LAP-2α увеличивался с возрастом. Содержание LAP-2α в ядрах фибробластов уменьшалось от 0 до 20 лет, а после 21 года постепенно увеличивалось. Общее число фибробластов и PCNA-положительных фибробластов в дерме уменьшалось с возрастом. Наиболее значительное снижение числа фибробластов отмечено на протяжении от 20 недель беременности до 20 лет.

Обсуждение: на сегодняшний день имеются свидетельства важного участия ламинов в деятельности клеточного ядра: организации гетерохроматина, трехмерной конформации генома и т.д. Изменения экспрессии ядерных ламинов, доли иммунопозитивных к ламинам фибробластов и ассоциированных с ними белков, установленные в настояшей работе, имеют возрастзависимый характер. Это обстоятельство позволяет предположить, что ламины и ассоциированные с ними белки могут оказывать влияние на процессы пролиферации и дифференцировки фибробластов кожи в онтогенезе и, как следствие, на обеспечение физиологических функций и возрастные изменения кожи.

Выводы: Результаты работы позволяют предположить участие ядерных ламинов и LAP-2α в возрастном уменьшении численности фибробластов в дерме человека.

Работа поддержана грантом РФФИ 16-44-210018.

ИЗУЧЕНИЕ ОБРАЗОВАНИЯ МУЛЬТИМОЛЕКУЛЯРНЫХ КОМПЛЕКСОВ ДРОЖЖЕВОГО БЕЛКА NHP6 СО СВОБОДНОЙ И НУКЛЕОСОМНОЙ ДНК

КОЗЛОВА А.Л., ГЕРАСИМОВА Н.С., ВАЛИЕВА М.Е., СТУДИТСКИЙ В.М.

МГУ ИМ.М.В.ЛОМОНОСОВА, МОСКВА

Цель: Nhp6 – это небольшой белок дрожжей с молекулярной массой 10,81 кДа, неспецифично связывающий ДНК. Этот белок присутствует в большом количестве в ядре дрожжей и входит в состав нескольких комплексов (к примеру, комплекса FACT), взаимодействующих с хроматином и играющих жизненно важную роль в метаболизме клетки. Однако механизм взаимодействия Nhp6 с нуклеосомой в биологических процессах до сих пор недостаточно изучен. Целью работы было выяснить, отличается ли связывание Nhp6 со свободным фрагментом ДНК длиной 282 п.н. и с собранной на нём мононуклеосомой.

Методы: Исследуемые ДНК-фрагменты были получены методом полимеразной цепной реакции и очищены в агарозном геле. В ходе ступенчатого диализа против растворов с понижающейся ионной силой в присутствии донорного хроматина на них были собраны мононуклеосомы. ДНК или нуклеосомы инкубировали в различных условиях в присутствии разных количеств белка Nhp6, образование ДНК-белковых комплексов наблюдали за счет сдвига электрофоретической (ЭФ) подвижности в нативном полиакриламидном геле (ПААГ).

Результаты: В нашей работе мы получили ДНК, содержащую высокоаффинную к гистонам последовательность нуклеотидов 603 для посадки нуклеосомы и промоторный участок для транскрипции in vitro модельной РНК-полимеразой E. сoli. Мы определили, что при взаимодействии Nhp6 с одним и тем же фрагментом ДНК в свободном и связанном с гистоновым октамером виде наблюдается формирование одинакового количества комплексов, отличающихся по ЭФ подвижности в нативном ПААГ. При постепенном повышении концентрации белка было выявлено последовательное образование восьми мультимолекулярных комплексов. Каждый такой комплекс состоит из одного ДНК-содержащего субстрата и некоторого количества молекул Nhp6. При образовании восьмого комплекса наблюдается насыщение связывания, причем в случае свободной ДНК это происходит при меньшей концентрации белка. Кроме того, было показано, что при повышении ионной силы раствора образование мультимолекулярных комплексов проходит более эффективно, чем при низкой ионной силе, и, как следствие, насыщение комплекса происходит при более низких концентрациях.

Обсуждение: Методом наблюдения за ЭФ подвижностью ДНК-белковых комплексов в нативном ПААГ мы определили, нуклеосомная организация не влияет на количество молекул Nhp6, которые могут связаться с ДНК. Из данных литературы известно, что белок Nhp6 связывается с участком ДНК длиной 10-15 п.н.. Поскольку в среднем на молекулу Nhp6 приходилось 35 п.н., скорее всего, молекулы Nhp6 могут одновременно связываться только на некотором расстоянии друг от друга вдоль спирали ДНК.

Выводы: 1. Как свободная, так и нуклеосомальная ДНК длиной 282 п.н. образуют с белком Nhp6 восемь комплексов, отличающихся по подвижности в нативном ПААГ. 2. В среднем на один связанный комплекс Nhp6 с ДНК приходилось 35 п.н. 3. Нуклеосомная организация снижает сродство Nhp6 к ДНК.

 

Материалы

Научного семинара

www.genetics-events.org

Мероприятие проводилось при поддержке Российского фонда фундаментальных исследований, Проект № 16-04-20923

Москва, 2016

СПОНСОРЫ СЕМИНАРА

Главный партнер семинара:

Компания БиоВитрум

http://www.biovitrum.ru/

- оплата приезда и проживания руководителя Геномной платформы Девида Жетьена из Института Кюри (Париж, Франция)

-оплата кофе-брейков

-предоставление реактивов для практической школы:

НАБОР ДЛЯ ВЫДЕЛЕНИЯ РНК компании Norgen

Cотрудники компании, принимавшие участие в семинаре и практической школе:

Элина ЧиганРуководитель группы Life Science [e-mail]

Алена АлексееваСпециалист по молекулярной биологии [e-mail]

Юлия КутузоваСпециалист по молекулярной биологии

 

3D БИОЛОГИЯ: Анализ экспрессии, копийности генов, белка и детекция мутаций, хромосомных перестроек. Контакты: [e-mail] 8-926-186-58-50 Миля