Заглавная страница Избранные статьи Случайная статья Познавательные статьи Новые добавления Обратная связь КАТЕГОРИИ: АрхеологияБиология Генетика География Информатика История Логика Маркетинг Математика Менеджмент Механика Педагогика Религия Социология Технологии Физика Философия Финансы Химия Экология ТОП 10 на сайте Приготовление дезинфицирующих растворов различной концентрацииТехника нижней прямой подачи мяча. Франко-прусская война (причины и последствия) Организация работы процедурного кабинета Смысловое и механическое запоминание, их место и роль в усвоении знаний Коммуникативные барьеры и пути их преодоления Обработка изделий медицинского назначения многократного применения Образцы текста публицистического стиля Четыре типа изменения баланса Задачи с ответами для Всероссийской олимпиады по праву Мы поможем в написании ваших работ! ЗНАЕТЕ ЛИ ВЫ?
Влияние общества на человека
Приготовление дезинфицирующих растворов различной концентрации Практические работы по географии для 6 класса Организация работы процедурного кабинета Изменения в неживой природе осенью Уборка процедурного кабинета Сольфеджио. Все правила по сольфеджио Балочные системы. Определение реакций опор и моментов защемления |
Специфическая комбинационная способность
Специфическая комбинационная способность – это оценка генетического качества каждой из комбинаций родителей в их родительских парах, устанавливаемая по результатам сравнительного изучения потомков-сибсов и полусибсов от разных комбинаций скрещивания. Она представляет собой оценку способности испытываемых плюсовых деревьев (или иного испытываемого материала) давать в определенных комбинациях скрещивания наилучшее потомство. Та комбинация скрещивания двух родительских форм, которая дает наилучшее по селектируемым признакам потомство, обладает и наивысшей специфической комбинационной способностью. Специфическая комбинационная способность – это относительная способность организма передавать генетическое превосходство потомкам при скрещивании только с некоторыми другими организмами. Высокая СКС обычно указывает на наличие доминирования, сверхдоминирования и эпистаза (Райт, 1978, стр. 447). Указаниями по лесному семеноводству в РФ (2000, п. 4.2, стр.14) определен порядок получения оценок ОКС. Специфическая комбинационная способность плюсового дерева определяется как величина превышения показателя исследуемого признака у его потомства, полученного от конкретной комбинации контролируемого скрещивания с определенным партнером того же или другого вида (Указания …, 2000, п.4.2, стр. 14).
Метод анализа Гибриды F 1 (например, семенное потомство плюсовых деревьев) изучают в полевом опыте с повторностями в блоках или решетках (латиссы). В лесной селекции гибридное потомство изучаемых плюсовых деревьев высаживают в испытательных культурах. Они могут иметь рядовые или блочные схемы размещения посадочных мест. В каждом блоке (делянке) необходимо иметь 10 – 15 растений. Изучаемым признаком может быть любой количественный признак, на который ведется селекция в соответствии с её задачами. Результаты полевого опыта подвергают дисперсионному анализу, чтобы определить остаточную вариансу . Дисперсионный анализ ведут на основе измерения гибридного потомства по каждой родительской форме (при оценке ОКС) и по каждой комбинации скрещивания (при оценке СКС). Одной из сфер применения дисперсионного двухфакторного анализа является определение общей комбинационной способности (ОКС) и специфической комбинационной способности (СКС) при осуществлении селекции методом гибридизации и в гибридологическом анализе результатов селекции методом отбора. В этих ситуациях оценивается степень проявления (сохранения) признаков родителей у потомства первого поколения (F 1). Иерархические комплексы строятся по следующей схеме: иерархическим уровнем высшего порядка (фактор А) выступает набор комбинаций скрещивания (диалельных прямых и реципрокных), рангом низшего порядка (фактор В) является набор повторностей каждой комбинации скрещивания (в идеальном случае на нескольких клонах материнской особи при одном источнике пыльцы) в пределах одной комбинации скрещивания.
ПРИМЕР 1 (реконструкция полной схемы контролируемых диаллельных скрещиваний по Ю.Л. Гужову и др., 1991). Пусть требуется определить комбинационную способность (вначале ОКС, а затем и СКС) 6 исходных родительских форм ели, при диаллельном прямом скрещивании которых было получено 15 гибридов – гибридных семей полных сибсов (а =15), которые были размещены в 6 повторностях (b =6) по 12 растений в каждой (с =12) на одном опытном участке. Измеряемым параметром выступала высота ствола деревьев в 10-летнем возрасте, выраженная в сантиметрах. Предлагается следующая принципиальная схема двухфакторного простого дисперсионного анализа (табл. 6.2).
Таблица 6.2. Схема дисперсионного анализа высоты гибридов (полусибсов) ели
Из полученного значения среднего квадрата отклонений (ms) для оценки величин остаточной дисперсии (вариансы) Me (Me =5,84) можно вычислить скорректированное значение этого показателя, Me ', необходимое для дальнейшего анализа (1): (1)
Оно учитывает эффект влияния числа родительских особей в диаллельной схеме, количества групп (гибридных семей) и их численностей. Для нашего примера с 6 повторностями и 12 растениями в каждой повторности это значение будет равно (2): (2)
По сути дела, исправленная оценка среднего квадрата отклонений остаточной дисперсии представляет собой отношение суммы квадратов отклонений остаточной дисперсии к исправленному числу степеней свободы (3). (3)
Оценка компонентов вариансы Собственно анализ комбинационной способности проводят по формулам, приведенным в таблице 3 и ниже.
Таблица 6.3. Схема дисперсионного анализа для определения комбинационной способности при одностороннем диаллельном скрещивании плюсовых деревьев ели европейской
Вычисление компонентов дисперсионного анализа проводят в представленном ниже порядке.
Сумма квадратов, обусловленная общей комбинационной способностью (ОКС) вычисляется по формуле (4): (4)
Сума квадратов, обусловленная специфической комбинационной способностью (СКС) вычисляется по формуле (5): (5)
Достоверность эффектов общей и специфической комбинационной способности определяют с помощью F-критерия Фишера. Для эффектов общей комбинационной способности используем формулу (6): (6)
В соответствии с таблицей 6.3, число степеней свободы равно: - для значения Mg kg = p – 1; - для значения Me ’ ke = m.
Для эффектов специфической комбинационной способности используем формулу (7): (7)
В соответствии с таблицей 3, число степеней свободы, в частности для M s равно (8): k s= p (p – 3)/2 (8)
Общую комбинационную способность любой родительской формы (i) определяют по формуле (9): (9)
Варианса ОКС определенной родительской формы равна (10): (10)
Специфическая комбинационная способность пары родительских компонентов (ij) определяют по формуле (11): (11)
Варианса специфической комбинационной способности определенной родительской формы составляет (12): (12)
Порядок выполнения расчетов. Данное задание предусматривает последовательное решение комплекса задач, выполнение которых мы рассмотрим на уже использованном выше примере.
В рассматриваемом нами примере проводилось одностороннее прямое диаллельное скрещивание 6 родительских форм, в результате которого было получено 15 полусибсовых семей гибридного потомства F 1. Количество гибридных семей (15) соответствует расчетному числу Гриффинга (1/2× р ×(р – 1)). Варианты самоопыления исключались из схемы опыта. Характеристики родителей (плюсовых деревьев) также не учитывались. Испытание проводилось в шести повторностях (на 6 разных учетных участках испытательных культур или питомника) по 12 гибридных растений в каждой повторности. Анализировалась высота сеянцев в возрасте 20 лет. Средние значения анализируемого признака, представляющие собой средние арифметические значения по каждой полусибсовой семье из 6 повторностей с 12 гибридными сеянцами в каждой сведены в таблице 6.4.
Таблица 6.4. Средняя для полусибсовой семьи высота ствола (см) у гибридов F1 ели Шренка и исходные значения для определения комбинационной способности её плюсовых деревьев (по Гужову, Фуксу, Валичеку, 1991)
Помимо экспериментально полученных данных, для каждой из 6 родительских форм (x ij.), приведенных в верхней правой части матрицы, для каждого из 6 плюсовых деревьев вычисляют сумму значений признака (в данном примере по средним значениям для каждой комбинации скрещиваний) у F 1 (F1 ij = Рi × Рj) соответствующей полусибсовой семьи: всех потомков-полусибсов отдельно для каждого из испытываемых плюсовых деревьев (Рi) в его сочетаниях со всеми другими (Рj). Величина имеет обозначение: (x i = Σ x ij):
и соответствующие квадраты этих сумм (x i 2 = [Σ x ij ]2):
а также общую сумму этих квадратов сумм значений полусибсовых семей по каждому полному набору комбинаций скрещиваний каждого ПД (Σ x i 2); Σ x i 2 = 1083004,60. Σ (Σ x ij)2
На следующем этапе рассчитывают: - сумму всех значений признака полученных в данной схеме испытаний полусибсовых семей (в рассматриваемом примере только прямые односторонние скрещивания): вычисляется как сумма полученных в данном испытании средних (x ij.) по комбинациям (в нашем случае только прямые односторонние скрещивания, см. табл. 4) значений признака (x.. = [Σ Σ x ij.]):
- квадрат этой суммы (x..2 = [Σ Σ x ij.]2), x..2 = (1274,3)2 = 1623840,49; - общую сумму квадратов значений признака всех гибридов F 1 (F1 ij = Рi × Рj) – в нашем случае одностороннего скрещивания (только прямые скрещивания), (Σ Σ x 2 ij.), Σ Σ x 2 ij. = 108405,73.
Кроме того, вычисляют полную сумму сумм значений признака (в данном примере по приведенным средним значениям для каждой комбинации скрещиваний) у F 1 (F1 ij = Рi × Рj) соответствующей полной полусибсовой семьи: всех потомков-полусибсов каждого одного из испытываемых плюсовых деревьев (Рi) в его сочетаниях со всеми другими (Рj) – (Σ x i = Σ Σ x ij, если x i = Σ x ij); показатель используется в расчетах оценок ОКС:
полученная величина в формулах дальнейших расчетов ОКС обозначена как «2 × х..». Она соответствует общей сумме всех значений признака полусибсовых групп. Тогда для полной реципрокной схемы диаллельных скрещиваний получим (Σ x i = Σ Σ x ij) Σ x i = 2548,6. Вычисление компонентов дисперсии проводят по следующим формулам, используя полученные на предыдущем этапе значения.
1. Сумма квадратов, обусловленная общей комбинационной способностью (ОКС) - Sg (13): = 1/(6 – 2) × 1083004,6 – 4/6 × (6 – 2) × 162384,49 = 270751,15 – 270640,08 = 111,07. (13)
2. Сума квадратов, обусловленная специфической комбинационной способностью (СКС) - Ss (14): = 108405,73 – 1/(6 – 2) × 1083004,6 + + 2/[(6 – 1) × (6 – 2)] ×1623840,49 = 108405,73 – 270751,15 + 162384,05 = 38,63. (14)
На следующем этапе составляют таблицу варианс (дисперсий).
Таблица 6.5.
Таблица варианс для определения комбинационной способности
Достоверность эффектов общей и специфической комбинационной способности определяют с помощью F-критерия Фишера.
Для эффектов общей комбинационной способности (15): = 22,21 / 0,08 = 277,6 (табличное значение 4,37). (15)
В соответствии с таблицей 6.3, число степеней свободы равно: - для значения M g (16) k g = p – 1 = 6 – 1 = 5; (16) - для значения M e’ (17) k e = m = a × b ×(c –1) = 990. (17)
Для эффектов специфической комбинационной способности (18): = 4,29 / 0,08 = 53,6 (табличное значение 2,71). (18)
В соответствии с таблицей 6.3, число степеней свободы равно: - для значения Ms (19): k s = p (p – 3)/2 = 9; (19) - для значения Me’ (20): k e = m = a × b ×(c –1)= 990. (20)
Из представленных расчетов и сравнений видно, что и фактическое (опытное, эмпирическое) значение дисперсионного отношения (критерия Фишера) общей комбинационной способности и фактическое (опытное, эмпирическое) значение дисперсионного отношения (критерия Фишера) специфической комбинационной способности превышают соответствующие табличные значения. Это свидетельствует о том, что значения общей и специфической комбинационной способности достоверны. Полученный результат обусловливает возможность и целесообразность (создает основания, предпосылки для) продолжения генетического анализа, который будет состоять в определении общей комбинационной способности для каждой родительской формы (плюсового дерева) и специфической комбинационной способности для каждой их пары в прямых односторонних скрещиваниях.
При диаллельном скрещивании для каждого родительского компонента (i) – любой родительской формы – общую комбинационную способность (gi) определяют по формуле (21): (21)
Варианса ОКС определенной родительской формы равна (22): (22)
Тогда для каждой из родительских форм (плюсового дерева) получим следующие значения общей комбинационной способности (gi): g1 = 1/[6×(6 – 2)] × (6 × 409,5 – 2 × 1274,3) = – 3,82; g2 = 1/[6×(6 – 2)] × (6 × 418,2 – 2 × 1274,3) = – 1,64; g3 = 1/[6×(6 – 2)] × (6 × 427,3 – 2 × 1274,3) = 0,63; g4 = 1/[6×(6 – 2)] × (6 × 428,7 – 2 × 1274,3) = 0,98; g5 = 1/[6×(6 – 2)] × (6 × 428,7 – 2 × 1274,3) = 0,98; g6 = 1/[6×(6 – 2)] × (6 × 439,2 – 2 × 1274,3) = 2,86.
Оценки вариансы для ОКС каждой особи получают в результате следующих расчетов: σgi = – 3,822 – (6 – 1)/[6×(6 – 2)] × 0,08 = 14,58; σgi = – 1,642 – (6 – 1)/[6×(6 – 2)] × 0,08 = 2,67; σgi = 0,632 – (6 – 1)/[6×(6 – 2)] × 0,08 = 0,38; σgi = 0,982 – (6 – 1)/[6×(6 – 2)] × 0,08 = 0,94; σgi = 0,982 – (6 – 1)/[6×(6 – 2)] × 0,08 = 0,94; σgi = 2,862 – (6 – 1)/[6×(6 – 2)] × 0,08 = 8,16.
Расчеты для каждой родительской формы сводят в таблицу 6.6.
Таблица 6.6. Общая комбинационная способность родительских форм (плюсовых деревьев ели Шренка)
Специфическая комбинационная способность пары родительских компонентов (ij) определяют по формуле (23): , где: (23) - x i-j – среднее значение признака всех потомков-сибсов каждой конкретной комбинации скрещивания двух родителей (Pi × Pj), участвующих в испытаниях потомств; - x i – сумма значений признака F1 соответствующей полусибсовой группы (всех потомков-полусибсов одного из родителей, во всех его комбинациях с каждым их других плюсовых деревьев) – «первого» из двух родителей (Pi) со всеми остальными; - x j – сумма значений признака F1 соответствующей полусибсовой группы (всех потомков-полусибсов одного из родителей, во всех его комбинациях с каждым их других плюсовых деревьев) – «второго» из двух родителей (Pj) со всеми остальными; - x .. – общая сумма значений признака всех полусибсовых групп (всех полученных в опыте потомков-полусибсов) реализованной в данной опыте (схеме) испытаний потомств прямой схемы диаллельных скрещиваний. Варианса специфической комбинационной способности определенной родительской формы составляет (24): (24)
Для всех комбинаций прямого одностороннего скрещивания плюсовых деревьев, участвующих в испытаниях потомств, принадлежащих родителям «первому» и «второму» (Р1 × Р2) получим: S1-2 = x 1-2 –1/(6–2)×(x 1+ x 2)+2/(6–1)×(6–2)× x..=81,1–¼×(409,5+418,2)+2/20×(1274,3)=1,60 S1-3 = x 1-3 –1/(6–2)×(x 1+ x 3)+2/(6–1)×(6–2)× x..=83,1–¼×(409,5+427,3)+2/20×(1274,3)=1,33 S1-4 = x 1-4 –1/(6–2)×(x 1+ x 4)+2/(6–1)×(6–2)× x..=82,2–¼×(409,5+428,7)+2/20×(1274,3)=0,08 S1-5 = x 1-5 –1/(6–2)×(x 1+ x 5)+2/(6–1)×(6–2)× x..=81,1–¼×(409,5+428,7)+2/20×(1274,3)=-1,02 S1-6 = x 1-6 –1/(6–2)×(x 1+ x 6)+2/(6–1)×(6–2)× x..=82,0–¼×(409,5+436,2)+2/20×(1274,3)=-2,00 S2-3 = x 2-3 –1/(6–2)×(x 2+ x 3)+2/(6–1)×(6–2)× x..=85,1–¼×(418,2+427,3)+2/20×(1274,3)=1,16 S2-4 = x 2-4 –1/(6–2)×(x 2+ x 4)+2/(6–1)×(6–2)× x..=85,0–¼×(418,2+428,7)+2/20×(1274,3)=0,70 S2-5 = x 2-5 –1/(6–2)×(x 2+ x 5)+2/(6–1)×(6–2)× x..=82,0–¼×(418,2+428,7)+2/20×(1274,3)=-2,30 S2-6 = x 2-6 –1/(6–2)×(x 2+ x 6)+2/(6–1)×(6–2)× x..=85,0–¼×(418,2+436,2)+2/20×(1274,3)=-1,17 S3-4 = x 3-4 –1/(6–2)×(x 3+ x 4)+2/(6–1)×(6–2)× x..=85,9–¼×(427,3+428,7)+2/20×(1274,3)=-0,67 S3-5 = x 3-5 –1/(6–2)×(x 3+ x 5)+2/(6–1)×(6–2)× x..=85,2–¼×(427,3+428,7)+2/20×(1274,3)=-1,37 S3-6 = x 3-6 –1/(6–2)×(x 3+ x 6)+2/(6–1)×(6–2)× x..=88,0–¼×(427,3+436,2)+2/20×(1274,3)=-0,44 S4-5 = x 4-5 –1/(6–2)×(x 4+ x 5)+2/(6–1)×(6–2)× x..=87,4–¼×(428,7+428,7)+2/20×(1274,3)=0,48 S4-6 = x 4-6 –1/(6–2)×(x 4+ x 6)+2/(6–1)×(6–2)× x..=88,2–¼×(428,7+436,2)+2/20×(1274,3)=-0,60 S5-6 = x 5-6 –1/(6–2)×(x 5+ x 6)+2/(6–1)×(6–2)× x..=93,0–¼×(428,7+436,2)+2/20×(1274,3)=4,20
ПРИМЕР 2. (реконструкция по М.М. Котову, 1997 с необходимой коррекцией и дополнениями).
Пусть требуется оценить общую и специфическую комбинационную способность родительских деревьев дуба черешчатого по высоте 20-летнего потомства, полученного от односторонних прямых диаллельных скрещиваний. Исходные данные приведены в таблице 6.7. Расчет ведется по схеме равномерного (ортогонального) дисперсионного двухфакторного комплекса при независимых факторах. Результаты учета и их первичной обработки приведены в таблице.
Таблица 6.7. Высота гибридов плюсовых деревьев дуба (в возрасте 20 лет)
Примечание. Принципиально возможно добавить информацию о дисперсионном анализе – базовая модель, двухфакторная модель.
Для дальнейших расчетов полезно сформировать таблицу значений степеней свободы для каждого источника изменчивости и численностей градаций каждого из организованных факторов (табл. 6.7).
Таблица 6.7. Числа степеней свободы для разных источников варьирования
В таблице при определении числа степеней свободы остаточной или средовой или случайной или экотипической изменчивости исходим из представления о числе степеней свободы остаточной дисперсии как о разности между общим числом степеней свободы и степенями свободы всех организованных факторов (Гужов, Фукс, Валичек, 1991, стр. 334; Доспехов, 1973, стр. 167 – 168; Лакин, 1980, стр. 219, 221, 233), а именно (25): a×b×(c – 1)×b×c = (a×b×c – a×b) × b×c = (25)
Тогда получим (26): = (a – 1) × (r – 1) × n = (a×r – r – a +1) × n = a×r×n – r×n – a×n + n = a×r×n – (r×n + a×n) + n = a×r×n – n×(r + a) + n = a×r×n – n×(r + a) – 1. (26)
Исходные данные и начальные этапы проведения двухфакторного неиерархического дисперсионного анализ семенного потомства плюсовых деревьев дуба черешчатого представлены в таблице 6.8.
Таблица 6.8. Дисперсионный анализ высоты 20-летних гибридов дуба
Решение задачи состоит из трех этапов: 1. доказательство существенности различий между гибридными комбинациями; 2. доказательство наличия эффектов комбинационной способности; 3. анализа комбинационной способности отдельных родителей и вариантов скрещивания.
Этап. Различия между гибридными комбинациями оцениваются по F критерию Фишера в двухфакторном дисперсионном комплексе (табл. 6.8).
1. Вычисляем общую сумму квадратов отклонений:
.
2. На следующем этапе находим межгрупповой квадрат отклонений – общий факториальный квадрат отклонений:
Здесь величина Н вычисляется по нижеприведенной формуле:
3. Далее находим вспомогательную промежуточную величину – сумму взвешенных квадратов сумм по фактору А (по отношению к числу вариант в пределах каждой соответствующей градации фактора А) для расчета суммы квадратов отклонений по фактору А:
4. После этого определяем сумму квадратов отклонений по первому фактору – фактору высшего уровня иерархии (фактору А):
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Последнее изменение этой страницы: 2021-03-09; просмотров: 132; Нарушение авторского права страницы; Мы поможем в написании вашей работы! infopedia.su Все материалы представленные на сайте исключительно с целью ознакомления читателями и не преследуют коммерческих целей или нарушение авторских прав. Обратная связь - 3.12.155.100 (0.275 с.) |