Аминокислоты, содержащие в радикале дополнительную аминогруппу или гуанидильный остаток.

Строение радикала кислоты -R	Название		Условное обозначение
	Тривиальное	Cистематическое
	Лизин	2,6-диамино-гексановая	Лиз Lys
	Аргинин (содержит гунидиновую группу)	2-амино-5-гуанидил-пентановая	Арг Arg

Аминокислоты, которые содержат в радикале дополнительную карбоксильную или амидную группы:

Строение радикала кислоты -R	Название		Условное обозначение
	Тривиальное	Cистематическое
	Аспарагиновая	2-аминобутан-диовая	Асп Asp
	Глутаминовая	2-аминопентан-диовая	Глу Glu
	Аспарагин	2-амино-3-карбоксамидо-пропановая	Асн Asn
	Глутамин	2-амино-4-карбоксамидо-бутановая	Глн Gln

Ароматические и гетероциклические аминокислоты:

Строение радикала кислоты -R	Название		Условное обозначение
	Тривиальное	Cистематическое
	Фенилаланин	2-амино-3-фенил-пропановая	Фен Phe
	Триптофан	2-амино-3-индол-илпропановая	Три Trp
	Гистидин (иминокислота)	2-амино-3-имидо-золилпропановая	Гис His
	Пролин (полная форма)	2-пирролидин-карбоновая	Про Pro

1.2. Стереоизомерия аминокислот

Все природные α-аминокислоты, кроме глицина (NH₂ - CH₂ - COOH), имеют асимметрический атом углерода (α-углеродный атом), а некоторые из них даже два хиральных центра, например, треонин. Таким образом, все аминокислоты могут существовать в виде пары несовместимых зеркальных антиподов (энантиомеров).

За исходное соединение, с которым принято сравнивать строение
α-аминокислот принимают D- и L-молочные кислоты, конфигурации которых, в свою очередь, установлены по D- и L-глицериновым альдегидам.

Все превращения, которые осуществляются в этих рядах при переходе от глицеринового альдегида к α-аминокислоте, выполняются в соответствии с главным требованием - они не создают новых и не разрывают старых связей у асимметрического центра.

Для определения конфигурации α-аминокислоты в качестве эталона часто используют серин (иногда аланин). Конфигурации их так же выведены из D- и L-глицериновых альдегидов:

Природные аминокислоты, входящие в состав белков, относятся к L-ряду.
D-формы аминокислот встречаются сравнительно редко, они синтезируются только микроорганизмами и называются «неприродными» аминокислотами. Животными организмами D-аминокислоты не усваиваются. D- и L-аминокислот  по разному действуют на вкусовые рецепторы: большинство аминокислот L-ряда имеют сладкий вкус, а аминокислоты D-ряда - горькие или безвкусные.