Заглавная страница Избранные статьи Случайная статья Познавательные статьи Новые добавления Обратная связь КАТЕГОРИИ: АрхеологияБиология Генетика География Информатика История Логика Маркетинг Математика Менеджмент Механика Педагогика Религия Социология Технологии Физика Философия Финансы Химия Экология ТОП 10 на сайте Приготовление дезинфицирующих растворов различной концентрацииТехника нижней прямой подачи мяча. Франко-прусская война (причины и последствия) Организация работы процедурного кабинета Смысловое и механическое запоминание, их место и роль в усвоении знаний Коммуникативные барьеры и пути их преодоления Обработка изделий медицинского назначения многократного применения Образцы текста публицистического стиля Четыре типа изменения баланса Задачи с ответами для Всероссийской олимпиады по праву Мы поможем в написании ваших работ! ЗНАЕТЕ ЛИ ВЫ?
Влияние общества на человека
Приготовление дезинфицирующих растворов различной концентрации Практические работы по географии для 6 класса Организация работы процедурного кабинета Изменения в неживой природе осенью Уборка процедурного кабинета Сольфеджио. Все правила по сольфеджио Балочные системы. Определение реакций опор и моментов защемления |
Классификация и номенклатура ферментов
В 1961 г. в Москве Комиссия по ферментам Международного биохимического союза (IUBМВ) приняла современную систематическую классификацию ферментов, учитывающую их реакционную и субстратную специфичность. Согласно классификации ферменты делят на классы – по типу катализируемой реакции, класс делят на подклассы – по природе атакуемой химической группы, подклассы делят на подподклассы – по характеру атакуемой связи или по природе акцептора или кофермента. Всего выделяют 6 классов: I. Оксидоредуктазы II. Трансферазы III. Гидролазы IV. Лиазы V. Изомеразы VI. Лигазы Каждому ферменту присвоен классификационный номер. Так, алкогольдегидрогеназа КФ 1.1.1.1. (оксидоредуктаза, действует на ОН‑группу донора с НАД+ в качестве акцептора, с 1-ым порядковым номером в своем подподклассе). Ферменты могут иметь тривиальное и систематическое название: 1. Тривиальное название сложилось исторически, более употребимо (пепсин, трипсин). Иногда к названию субстрата добавляют окончание "‑аза" (уреаза, амилаза, липаза). Однако у всех ферментов есть и систематическое название. 2. Систематическое название присваивают согласно современной классификации (http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/). Зачастую оно сложно в использовании, тогда его упрощают и вводят рабочее название. I класс. Оксидоредуктазы Ферменты катализируют окислительно-восстановительные реакции, лежащие в основе биологического окисления. Коферменты: НАД+, НАДФ+, ФАД, ФМН, убихинон, глутатион, липоат. В классе 22 подкласса, основные из них включают группы ферментов, действующие на: 1.1. CH-OH группу доноров; 1.2. альдегидную/кетоновую группу доноров; 1.4. CH-NH2 группу доноров; 1.5. CH-NН группу доноров; 1.6. НАДH или НАДФН в качестве доноров; 1.8. S‑содержащие группы доноров; 1.9. гем‑содержащие доноры; 1.11. Н2О2 в качестве акцептора; 1.12. водород в качестве донора; 1.13. один донор с включением О2; 1.14. два донора с включением О2; 1.15. О2• ‑ в качестве акцептора. На подподклассы делят в зависимости от акцептора – НАД+ / НАДФ+ (1.1.1., 1.2.1., 1.3.1., 1.4.1.), дисульфиды (1.2.4.), кислород (1.3.3.). Наиболее распространенные рабочие названия оксидоредуктаз: 1. Дегидрогеназы – оксидоредуктазы, катализируют дегидрирование субстрата, когда акцептор водорода – любая молекула, кроме кислорода.
2. Редуктазы – оксидоредуктазы, для которых перенос водорода от молекулы донора трудно доказуем. 3. Оксидазы – оксидоредуктазы, катализируют окисление субстратов с молекулярным кислородом в качестве акцептора электронов без включения кислорода в молекулу субстрата. 4. Монооксигеназы – оксидоредуктазы, катализируют внедрение 1 атома кислорода в молекулу субстрата с молекулярным кислородом в качестве донора. 5. Диоксигеназы – оксидоредуктазы, катализируют внедрение 2 атомов кислорода в молекулу субстрата с молекулярным кислородом в качестве донора. 6. Пероксидазы – оксидоредуктазы, катализируют реакции с пероксидом водорода в качестве акцептора электронов. Систематическое название оксидоредуктаз образуется так: донор электронов: акцептор электронов – оксидоредуктаза. Пример 1
Пример 2
Пример 3
II класс. Трансферазы Катализируют реакции переноса различных групп от одного субстрата (донор) к другому (акцептор), участвуют в реакциях взаимопревращений различных веществ, обезвреживания природных и чужеродных соединений. Коферменты: пиридоксальфосфат, коэнзим А, ТГФК, метилкобаламин. В классе 9 подклассов – в зависимости от строения переносимых групп, на подклассы ферменты делят в зависимости от вида переносимой группы:
2.1. переносящие одноуглеродные фрагменты; 2.2. переносящие альдегидные и кетогруппы; 2.3. переносящие ацильные группы; 2.4. переносящие гликозильные группы; 2.6. переносящие азотсодержащие группы; 2.7. переносящие фосфорсодержащие группы; 2.8. переносящие сульфосодержащие групп;. 2.9. переносящие селенсодержащие группы. На подподклассы делят в зависимости от природы переносимой группы. Систематическое название трансфераз образуется так: Донор группы: акцептор группы – переносимая группа трансфераза. Пример 1
Пример 2
Пример 3
III класс. Гидролазы Гидролазы — осуществляют разрыв внутримолекулярных связей в субстрате (за исключением С-С связей) путем присоединения элементов Н2О. Гидролазы подразделяют на 13 подклассов. Коферменты у всех гидролаз отсутствуют. Ввиду сложности многих субстратов у ряда ферментов сохранены тривиальные названия: пепсин, трипсин, эластаза. Гидролазы сосредоточены в основном в желудочно-кишечном тракте и в лизосомах клеток тканей. Осуществляют распад макромолекул, образуя легко адсорбируемые мономеры. В основные подклассы гидролаз выделяют группы ферментов, катализирующих гидролиз: 3.1. сложных эфиров; 3.2. О-гликозидов; 3.3. простых эфиров; 3.4. пептидов; 3.5. непептидных азот-углеродных связей; 3.6. ангидридов кислот; 3.7. углерод-углеродных связей. Среди подподклассов выделяют, например, гидролазы карбоновых кислот (3.1.1.), гидролазы фосфомоноэфиров (3.1.3.). Наиболее часто встречаются следующие гидролазы: 1. Эстеразы – гидролиз сложноэфирных связей. 2. Липазы – гидролиз нейтральных жиров. 3. Фосфатазы – гидролиз моноэфиров фосфорной кислоты. 4. Гликозидазы – гидролизуют О- и S-гликозидные связи. 5. Протеазы, пептидазы – гидролиз белков и пептидов. 6. Нуклеазы – гидролиз нуклеиновых кислот. Систематическое название гидролаз образуется следующим образом: Гидролизуемый субстрат: отделяемая группа – гидролаза. Пример 1
Пример 2
Пример 3
IV класс. Лиазы Лиазы — катализируют разрыв С–О, С–С, C–N и других связей, а также обратимые реакции отщепления различных групп субстратов по негидролитическому пути. Класс насчитывает около 230 ферментов. Выделяют 7 подклассов. Реакции сопровождаются образованием двойной связи или присоединением групп к месту двойной связи. Лиазы являются сложными ферментами, коферментами служат пиридоксальфосфат, тиаминдифосфат, магний, кобальт. На подклассы делят в зависимости от природы разрываемой связи: 4.1. углерод-углерод лиазы; 4.2. углерод-кислород лиазы; 4.3. углерод-азот лиазы; 4.4. углерод-сера лиазы; 4.5. фосфор-кислород лиазы. Среди подподклассов выделяют, например, карбоксилиазы (4.1.1.), гидролиазы (4.2.1.). Систематическое название ферментов класса лиаз образуют следующим образом: расщепляемый субстрат: отделяемая группа – лиаза. Пример 1
Пример 2
Пример 3
V класс. Изомеразы Изомеразы — катализ изомерных превращений в пределах одной молекулы. В классе более 80 ферментов, 6 подклассов. Изомеразы — сложные ферменты, коферментами являются дезоксиаденозилкобаламин, пиридоксалевые, пептидные (глутатион), фосфаты моносахаридов (глюкозо-1,6-дифосфат) и др. Изомеразы делят на подклассы по типу изомеризации: 5.1. Рацемазы, эпимеразы. Рацемазы — катализ взаимопревращений L-/D-изомеров, S-/R-изомеров. Эпимеразы изменяют конфигурацию при одном из хиральных атомов С: превращения рибулоза «ксилулоза, галактоза «глюкоза, манноза «галактоза, взаимопревращение a-/b-изомеров. 5.2. Цис-транс изомеразы. 5.3. Внутримолекулярные оксидоредуктазы.
5.4. Внутримолекулярные трансферазы – мутазы, осуществляют перенос химических групп внутри молекулы. 5.5. Внутримолекулярные лиазы. Среди подподклассов выделяют, например: действующие на аминокислоты и их производные (5.1.1.), на углеводы и их производные (5.1.3.), перемещающие двойные (С=С) связи (5.3.3.). Систематическое название изомераз образуется следующим образом: Субстрат – [ ] – реакция (где [ ] – обозначение, отражающее суть реакции, например, "номер изменяемого атома углерода", изменение "цис/транс", "кето/енол" или "альдозо/кетозо"). Пример 1
Пример 2
Пример 3
VI класс. Лигазы Лигазы (синтетазы) — ферменты, катализирующие присоединение друг к другу двух молекул с использованием энергии высокоэнергетических связей АТФ (или других макроэргов). Лигазы — сложные ферменты, содержат нуклеотидные, биотиновые, фолиевые коферменты. Выделяют 6 подклассов ферментов, формирующих связи: 6.1. Углерод-кислород. 6.2. Углерод-сера. 6.3. Углерод-азот. 6.4. Углерод-углерод. 6.5. Фосфор-кислород. 6.6. Азот-металл. Среди подподклассов выделяют, например: образующие связи аминоацил-тРНК (6.1.1.), синтезирующие соединения кислота-тиол (6.2.1.), амиды (6.3.1.). Систематическое название: Субстрат 1: субстрат 2 – лигаза. Пример 1
Пример 2
Приложение 4 Таблица основных гормонов
Примечание: 1) информацию представить по основным гормонам гипоталамуса, гипофиза, поджелудочной, надпочечников и половых желез, щитовидной и паращитовидных желез, гормонально активным формам витамина D3 (разделы 2,8), 2) дополнить графы таблицы по мере изучения частных вопросов биохимии и биохимии полости рта (разделы 9-12). Приложение 5
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Последнее изменение этой страницы: 2021-04-05; просмотров: 112; Нарушение авторского права страницы; Мы поможем в написании вашей работы! infopedia.su Все материалы представленные на сайте исключительно с целью ознакомления читателями и не преследуют коммерческих целей или нарушение авторских прав. Обратная связь - 3.137.157.45 (0.056 с.) |