Заглавная страница Избранные статьи Случайная статья Познавательные статьи Новые добавления Обратная связь FAQ Написать работу КАТЕГОРИИ: АрхеологияБиология Генетика География Информатика История Логика Маркетинг Математика Менеджмент Механика Педагогика Религия Социология Технологии Физика Философия Финансы Химия Экология ТОП 10 на сайте Приготовление дезинфицирующих растворов различной концентрацииТехника нижней прямой подачи мяча. Франко-прусская война (причины и последствия) Организация работы процедурного кабинета Смысловое и механическое запоминание, их место и роль в усвоении знаний Коммуникативные барьеры и пути их преодоления Обработка изделий медицинского назначения многократного применения Образцы текста публицистического стиля Четыре типа изменения баланса Задачи с ответами для Всероссийской олимпиады по праву Мы поможем в написании ваших работ! ЗНАЕТЕ ЛИ ВЫ?
Влияние общества на человека
Приготовление дезинфицирующих растворов различной концентрации Практические работы по географии для 6 класса Организация работы процедурного кабинета Изменения в неживой природе осенью Уборка процедурного кабинета Сольфеджио. Все правила по сольфеджио Балочные системы. Определение реакций опор и моментов защемления |
Регуляция на уровне транскрипции требует специфического взаимодействия днк и белковСодержание книги
Поиск на нашем сайте
Модель пространственной структуры ДНК предложенная Криком и Уотсоном в 1953 г на первый взгляд казалась монотонно устроенной структурой с жестко детерминированными расстояниями и углами поворота между основаниями. Однако более детальное исследование показало существование локальных особенностей структуры, позволяющих специфически узнавать эти особенности молекулам белков. Химические группы пар азотистых оснований хорошо «просматриваются» в большой и малой бороздках молекулы ДНК, создавая неповторимые сочетания, которые могут выполнять роль специфических знаков для узнавания белками. Рис. Схема расположения групп, участвующих в белков-нуклеиновокислотном узнава Выделены и исследованы сотни последовательностей нуклеотидов, используемых для специфического узнавания белками. Это обычно небольшие отрезки ДНК, некоторые из них приводятся ниже в таблице 10-9.
В основе молекулярного узнавания лежит принцип комплемнтарности между поверхностями двух молекул. В случае взаимодействия регуляторного белка и молекулы ДНК между поверхностью белка и структурой ДНК образуется множество специфических контактов (по меньшей мере, в 20 точках) при участии водородных связей, ионного и гидрофобного взаимодействий. Слабые взаимодествия в таком количестве делают это взаимодействие достаточно прочным. Исследование структуры многих белков, участвующих в регуляции экспрессии генов, позволило выделить несколько групп белков, объединенных общими признаками в структурной организации. Спираль-поворот-спираль. Первой изученной связывающей ДНК структурой в белке была структура названная спираль- поворот- спираль. Подобная структура, обеспечивающая специфическое связывание белка и ДНК обнаружена в сотнях ДНК связыващих белков и у прокариот и у эукриот. 2 спиральных участка молекулы согнутые под углом в области короткого линейного отрезка располагались таким образом, что С-концевой отрезок вписывался в большую бороздку ДНК и специфически узнавал определенную последовательность нуклеотидов. Как правило, все белки с такой структурой выполняли свою функцию в виде димеров. К этой группе белков относятся и гомеодомен: гомеодомен - высоко консервативный домен из 60 аминокислот, обнаруженный среди большого семейства факторов транскрипции. Это семейство было сначала идентифицировано у Drosophila (до 60 белков), а впоследующем обнаружены у всех живых организмов от дрожжей до человека. Эти белки кодируются группой генов, изменение которых, может вызвать нарушение номального формирования организма (преобразования одной части тела в другую, так называемые гомеотические преобразования). Этот класс генов был идентифицирован как у беспозвоночных так и позвоночных. Сам гомеодомен формирует структуру, высоко подобную бактериальным белкам типа спираль-поворот-спираль. Цинковые пальцы: Если структура спираль-поворот-спираль состоит только из аминокислот, второй тип наиболее часто встречающихся типов структур узнающих ДНК содержит в качестве стабилизирующего элемента ион цинка. Существует целое семейство таких белков, наиболее простой из которых составлен из a спирального отрезка цепи и отрезка с b - структурой, связанных между собой ионами цинка. Этот тип белков участвует в регуляции транскрипции рибосомных РНК (фактор транскрипции РНК pol III, TFIIIA). Второй вариант такой структуры составлен из 2-х a- спиральных участков, также связанных ионами цинка. К ним относятся внутриклеточные рецепторы стероидных гормонов и гомонов щитовидной железы. Атомы цинка связываются с остатками цистеина и гистидина, способствуя формированию пальцевидных структур. И тот и другой варианты используют a -спиральные структуры для узнавания участков. Области пальца могут "вставляться " в главное углубление спирали ДНК. Интервал цинковой области пальца в этом классе факторов транскрипции совпадает с полуповоротом двойной спирали. Спираль-петля-спираль (HLH): HLH домен формирует димеры. HLH домен составлен из двух a- спиральных областей, разделенных областью переменной длины, которая формирует петлю между 2 a – спиралями. Этот домен подобен структуре спираль-поворот-спираль, a спиральные области структурно подобны и необходимы для взаимодействия белка с элементами последовательности, которые обладают двойной осью симметрии. Этот класс факторов транскрипции наиболее часто содержит область основных аминокислот, расположенных на N – концевом участке HLH домена (такие белки обозначают как bHLH белки). Эти аминокислоты необходимы для связывания с ДНК по специфическим последовательностям. HLH область функционирует в форме гомо и гетеродимеров. Среди белков, имеющих HLH домен можно назвать MyoD (фактор транскрипции идуцирующий миогенез) и c-Myc (первоначально идентифицированный как ретровирусный онкоген). Некоторые HLH белки не содержат основной области и, образуя гетеродимеры с белками bHLH, действуют как репрессоры, подавляя активность bHLH белков. Лейциновая застежка - молния: как указывалось выше большинство белков, взаимодействуют с ДНК в форме димеров, причем в образовании димера участвуют последовательности аминокислот, которые не задействованы в самом механизме взаимодействия с ДНК. Белки с лейциновым доменом застежки - молнии сочетают при этом обе функции и образование димера и связывание с ДНК. В белке имеются участки богатые гидрофобными аминокислотами (часто лейцином) радикалы которого выступают из a спиральной структуры этого белка. Два белка с такими участками могут формировать суперспираль в которой выступающие группы радикалов лейцина взаимодействуют с лейциновыми радикалами другого мономера подобно застежке - молнии. Димер при этом приобретает Y- форму. Ножки этой структуры содержат участки узнавания последовательности ДНК. Область лейциновой застежки - молнии присутствует в многих связывающих ДНК белках, типа c-Myc, C/EBP и т.д.
|
||||||||||||||||||||||||||
Последнее изменение этой страницы: 2016-08-16; просмотров: 275; Нарушение авторского права страницы; Мы поможем в написании вашей работы! infopedia.su Все материалы представленные на сайте исключительно с целью ознакомления читателями и не преследуют коммерческих целей или нарушение авторских прав. Обратная связь - 3.149.235.66 (0.008 с.) |