Несовместимость и группы несовместимости.

Несовместимость и группы несовместимости.

К одной группе несовместимости (inc-группа) относят плазмиды, которые несовместимы между собой, но совместимы с любой плазмидой из другой группы. 

Существует более 30 inc-групп (табл. 3.1):

 

Таблица 3.1 – Группы несовместимости

Группа

Плазмида

B

R16, Tpll3, Tpl25, R723, R864a

C

R40a, R55, RAl, pIP55, pIP40a, pHH1343a

D

R711b, R778b

E

JA4320

F1

F, ColV2, ColV2-K94, ColV3-K90, ColV3, R386, R455, R773, R162, P307Ent,IP162, pAPl0-2, plP174, pHH507, PGH2387

FII

R192, NR1, Rl, Rldrdl9, R6, R6—5.1, SF119, R136, Rl-19k, R538Fdrdl, pHH1313d, pGD10

FIII

ColB-K98, MIP240Hly, R ColBM

FIV

R124, pJLl/Vir/, pAP17

FV

Folac, plT509, pIE1510

FVI

Hly-P212, pGL611, pSU212Hly, pSU105, Hly

FVII

pAP38

FVIII

pAP43

FIX

pAP42

FX

pAP19-1

G

Rmsl49

HI1

R27, R726, pPG 1251-2, TP123

HI2

R478, pAS251-2, pSD114. N-1, pWR23

HI3

MIP233

HII

PHH1457, pHH15O8a, pHH1532b-l, R62, R64, R144, R483, ColIb-P9

Il/I

R62, R64, R144, R483, ColIb-P9

Ig

R621a, ColIb-Iml420

Id

JR66a, R721

It

R905a

I2

TR114, R769, pHlyl52

J

R391, R997

K

R387, pTM559, pIE316, pkmr

M

R69, R446b, R471a, R831b, R46, pDT201,R390

N

N3, N3T, R15, R46, R477b, pKM10l, PCU1, RPC3, pIP113, R390

P

RP4, R751, R690, RP1, R18, pUZ8, pK2, R68, R702, R906

Q

R678, NPT7, R300b, NTP2, R839, R938, R995, R1033, RSF1010, R1I62, pKT214, R702, R751, R906, R772

S

R1033, R751, R906, R772

T

Pts-1, R394, R401, R402

U

pAr-32, pA3, R1460, pIE42O

V

R757, R753

W

RSa, R7K, R388, plP100b, pIP339

X

R6K, R485, TP231, TP228, TP227, R711b, TEMdrd, pHH1187

Y

PIcm P7, R753, R905, PI5b, pIP231, MIP231

 

Когда плазмиды не трансмиссивны в E.Coli их классифицируют в бактериях тех видов, в которых они выявлены. Плазмиды псевдомонад, не способные к переносу в E.Coli, классифицированы в Pseudomonas aeruginosa и других псевдомонадах на 11 групп. Плазмиды стрептококков и стрептомицетов также классифицированы на несколько inc-групп.

Для плазмид одной группы исключения сходна молекулярная масса, гомологичны многие последовательности нуклеотидов, сходны конъюгационные процессы, синтезируются серологически родственные пили. Как полагают многие исследователи, принадлежность плазмиды к той или иной группе несовместимости является отражением филогенеза последней.

Иногда проявляется атипичная несовместимость, когда плазмиды оказываются несовместимыми с плазмидами других групп несовместимости. Иногда одну плазмиду относят к нескольким inc-группам.

На данный момент предложено две модели механизма несовместимости:

· Репликоновая – основана на гипотезе позитивного контроля. Предполагается, что несовместимость обуславливается конкуренцией плазмид за сайты прикрепления к мембране клетки. Однако, к настоящему времени имеются данные, не укладывающиеся в такую модель. 

· Модель «разведения репрессора» - негативный контроль. Если плазмиды имеют одинаковые системы контроля копийности и, следовательно, обладают взаимной чувствительностью к детерминированию и репрессорам, то они будут несовместимы (т.к. в дочерние клетки разойдутся не копии одной плазмиды, а гомологичные несовместимые плазмиды, а синтез копий до деления клетки и тем самым разведения репрессора будет подавлен)ю