Классификация и номенклатура вирусов

 

Цель классификации любых классов организмов состоит в том, чтобы структурировать в разумные категории те из них, которые наиболее близки по каким-либо признакам. В основу такой группировки могут быть положены морфологические или физиологические критерии, либо те и другие. Идеал, к которому стремится человек, состоит в создании такой классификации, которая не противоречила бы эволюционным связям организмов, а также обеспечивала бы удобную и рациональную систему номенклатуры.

Если говорить о значении классификации вирусов, прежде всего, следует подчеркнуть, что классификация дает возможность предсказывать детали репликации вируса, патогенеза и способы распространения инфекции. Это имеет особо важное значение в том случае, когда проводится идентификация нового вируса.

Далее, если предпринимается изучение нового вида известного семейства или рода вирусов, его можно проводить, принимая во внимание информацию, которая уже накоплена исследователями при изучении других членов этой таксономической группы.

Классификация и номенклатура вирусов  всегда вызывала и вызывает (в силу специфики объекта) большие трудности. Как уже отмечалось выше, вирусы, скорее всего, являются сборной группой представителей, имеющих различное происхождение. К такой группе, строго говоря, затруднительно применять таксономические критерии. Поэтому, все современные классификации вирусов не претендуют на то, чтобы отражать филогенетической родство, а служат главным образом в качестве «таблиц для определения», используемых исследователями в практических целях.

Часто вирусы подразделяют в соответствии с природой их хозяев, т.е.,

на вирусы животных,

вирусы растений,

вирусы бактерий и т.д.

Однако даже такое подразделение не свободно от противоречий, поскольку вирусы растений способны размножаться в насекомых-переносчиках. Вирусы микроскопических грибов (микофаги) могут размножаться в бактериях. Поскольку подавляюще число вирусов было открыто как патогенные агенты в отношении человека, животных или растений, представляется рациональным в качестве главного критерия в классификации использовать вид хозяина, у которого впервые были обнаружены патогенные проявления того или иного вируса. Однако для самих вирусов часто более важны не те хозяева, которые представляют интерес для человека, а хозяева, в которых вирус как раз и вызывает наименьшие изменения.

Иногда при классификации вирусов используются особенности структуры вирусной частицы, которые могут быть установлены прямыми (электронная микроскопия) или непрямыми методами (биохимические или серологические исследования).

Однако в последнее время самым надежным подходом к классификации вирусов считается подход, которые базируется на учете типа и структуры вирусного генома.

Долгое время при классификации вирусов использовалась унифицированная схема, которая представлена на рис. 1.1.

 

 

Руководствуясь приведенной схемой, надо помнить, что таксон «порядок» обязан иметь в своем латинском наименовании суффикс «virales»;

в наименовании семейств присутствует суффикс «viridae»;    

Подсемейств – «virinae».